Bevor man einen Rundgang durch das Aquarium macht, wird es einen 9-minütigen Film über das Ökosystem des Rio Grande von der Quelle bis zur Einmündung ins Meer gezeigt. Der Schwerpunkt des Aquariums liegt auf den Lebensräumen am Golf von Mexiko, von den Salzsümpfen über die Korallenriffe bis zum vor Haien wimmelnden offenen Meer. Im botanischen Garten sind besonders die beiden klimatisierten Gewächshäuser, der Mediterranean Pavilion und der Desert Pavilion zu bewundern. Zusammen mit dem Zoo bilden diese Einrichtungen den Albuquerque Biological Park und den Children's Fantasy Garden.